为了深刻理解和正确运用基本理论，要注意下列各点：
首先，与论题有关的经典著作和重要文章要做到读懂读通。毕业论文作者要选定与论题密切有关的经典著作和重要文章，加以反复阅读，边读边想，直到读懂、想通与论题有关的理论问题，切忌一知半解或片面的理解。为了加深理解，最好的办法是做读书笔记，把与论题有关的理论要点、警句摘录下来，有了体会还可写读书心得，如果是自己的书或报刊、杂志则可以作眉批，或把疑点、难点作出标记注在上面，以备日后进一步研究。
其次，要科学地掌握理论，必须善于联系。一是联系理论所形成的客观条件，这样可以帮助我们更确切地理解这一理论的内容。比如，要撰写《关于培育和完善建筑劳动力市场的思考》，就必须把市场形成的前提条件联系起来考虑，掌握了市场形成的一般前提条件，自然而然也就引申出建筑劳动力市场形成的前提条件：其一，体制条件;第二，相关市场条件3其三，行业用工特殊性条件。二是联系与其相关的理论，这可以帮助我们进一步把握这一理论的实质。仍以上文为例，要揭示建筑劳动力市场产生的客观必然性，不仅要掌握社会主义市场经济理论，还应掌握与此相关的理论，譬如哲学原理，马克思主义的唯物辩证法认为，事物是普遍联系的，一事物的产生总是它事物作用的结果，从这一原理我们认识到，建筑劳动力市场之所以能在当代中国应运而生，也存在着孕育它产生的.必然的前提条件，这推动着我们去探究促使建筑劳动力市场产生的“他事物”。
最后，必须在理论指导下进行创造性的思考。撰写毕业论文必须有理论的指导，但是，理论并不能为人们提供解决问题的现成答案。因此，阅读经典著作和重要文章，决不能只是消极被动地接受其中的某些结论，而要创造牲地思考，努力从前人的知识中寻求某些启发，用以指导自己探索当前面临的问题。对于前人提出的结论中那些已经不适合现实情况部分，要敢于提出疑问，敢于提出新的看法，这并不像有人所认为的是“高不可攀”，只要我们刻苦钻研和思考问题，把所学到的前人论述一一用实践去检验它，把它一分为二，孰是孰非，把正确的错误的区分开来，分别排队研究，就自然会产生自己的见解，对前人的观点作出补充、发挥、纠正、批驳，就自然会形成自己的新观点，产生自己的毕业论文。历史学家张荫麟还在上清华中学时，就去大学旁听梁启超讲课，听后有不同意见，写了一篇反驳文章，文章质量很高，在杂志上刊登后，编辑以为是教授写的，将稿费寄到清华教授宿舍。梁启超十分欣赏他的才华，便精心培养他，结果，张荫肠二十几岁就成为一位历史学教授。一个十几岁的中学生能做到的，我们二十几岁的大学生，三四十岁的成人高校学生通过努力，为什么就做不到呢?更何况社会在不断地发展，前人提出的理论中那些没有涉及的问题必然会越来越多，我们要勇于思索，勇于开拓新的领域。
