有机化学是化学领域中重要的基础学科之一。北大的有机化学学科经过多年建设已有很好的基础，已经具备向国际一流水平发展的条件。以邢其毅院士为代表的老一辈科学家在50年代奠定了北大有机发展的基础，并在艰难的条件下和科学院的生物所及有机所合作完成了人工合成牛胰岛素的工作。北大有机化学专业是我国首批获得博士学位授权的专业，1987、2002和2007年三次被国家教委(教育部)评为重点学科，1992年建立生物有机分子工程教委开放实验室(现名为生物有机与分子工程教育部重点实验室)。经过几代人的努力，北大有机在科研和教学方面取得了丰硕的成果，为国家培养了大批优秀人才。近年来，有机学科在研究方向、优秀人才引进、实验室建设、课程设置以及博士和博士后培养等各方面均上升到更高的层次。特别是年轻的学术带头人积极活跃在学术前沿，使北大有机化学充满活力。目前的研究队伍中有长江学者3人，国家杰出青年科学基金获得者5人，教育部跨世纪学术带头人1人，2006年获得了国家自然科学基金委的优秀创新群体资助。学术研究方向经过近年的调整已经集中在有机化学研究的国际前沿和主流方向上(主要研究方向见下表)。
北大有机专业在基础研究的硬件设备方面经过近几年的建设已经大为改善，与国际先进水平的差距已经缩小。通过改善管理，设备的使用效率得以提高。例如我们在国内率先向研究生开放超导体核磁共振仪等分析测试仪器，极大地提高了科研工作的效率，同时也提高了研究生的培养水平。目前有机专业的所有分析仪器均可以由研究生操作(200，300，400兆核磁共振仪，红外，气相色谱，高效液相，气质联用，旋光仪等)。
有机专业的学术活动十分的活跃，每年有多位国内外一流学者前来访问讲学，研究生有许多机会和这些学者直接交流。同时，有机专业还组织研究生进行学术讲座，由每位研究生轮流归纳介绍学科的前沿领域。北大有机近年在科研方面已取得若干具有国际影响的成果。在有机化学的国际著名刊物上发表了多篇研究论文，其中有相当数量的论文发表在化学或有机化学领域公认的最权威学术刊物上，如J. Am. Chem. Soc.; Angew. Chem. Int. Ed.; J. Org. Chem. Org. Lett.等。特别需要提出的是这些高水平研究成果的绝大部分是有机专业研究生与导师合作共同完成的。有机专业的研究生毕业以后具有很好的就业前景。近年来的毕业生大部分到国内外一流科研机构以及制药公司等继续科学研究。北大有机专业培养的博士生已得到国内外同行的认可。
综上所述，北大有机化学专业具有悠久的历史并且充满活力，是一个在国内处于领先地位，在国际上具有一定影响的学科。
有关北大有机化学的详细情况，请访问网页：
主要研究方向如下表：
| 序号 | 研究方向名称 | 主要研究内容、特色与意义 | 指导教师 |
| 1 | 生物有机化学 | 具有生物活性的天然和类天然分子及具有识别功能的有机小分子的合成及功能研究；组合化学；化学生物学。 | 杨震 陈家华 施章杰 |
| 2 | 有机合成化学 | 具有复杂结构的天然产物的全合成；不对称合成，重点研究催化不对称合成。 | 杨震 |
| 3 | 金属有机化学 | 化学键的选择性切断与应用；双或多金属有机合成试剂；Lewis酸促进的化学反应与金属有机化合物促进的碳-碳键形成的结合；C-H键活化；富勒烯化学的研究。 | 席振峰 甘良兵 施章杰 |
| 4 | 物理及理论有机化学 | 有机化学反应机理的研究，特别是金属卡宾活性中间体的生成、反应及应用；有机自由基化学；计算化学。 | 王剑波 余志祥 |
| 5 | 材料有机化学 | 水溶性共轭高分子和小分子材料、以及全共轭树枝状材料的分子设计、合成。这类材料在有机发光二极管、化学和生物传感器、光收集放大器等方面具有潜在的应用前景。 | 裴坚 |
